RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288		M0R381	172 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	PDE6D	O43924	150 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	LTA	P01374	205 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM6	P0DI80	62 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	CRIP1	P50238	77 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	SLA	Q13239	276 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	RHEB	Q15382	184 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	CENPW	Q5EE01	88 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	ATRAID	Q6UW56	229 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	DERL1	Q9BUN8	251 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	CIDEA	O60543	219 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288		P01737	135 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM17	P0DL12	118 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	GZMB	P10144	247 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	BCL2	P10415	239 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	SRI	P30626	198 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYBA4	P53673	196 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	ESRG	Q1W209	222 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	TDRG1	Q3Y452	100 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	OCC1	Q8TAD7	63 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	RASL10A	Q92737	203 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	JPT2	Q9H910	190 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATXN3-238	ENST00000556288	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A087WWC5	75 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	COLCA2	A8K830	154 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF727	A8MUV8	499 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288		A8MWV9	139 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	RS1	O15537	224 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	S100A6	P06703	90 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	MGP	P08493	103 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	CFC1B	P0CG36	223 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	CFC1	P0CG37	223 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	VPREB1	P12018	145 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	ADCYAP1	P18509	176 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	C9orf85	Q96MD7	179 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288		Q9H8V8	135 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	IL36B	Q9NZH7	164 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	XKRY2	A2RUG3	117 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	C5orf52	A6NGY3	159 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288		K7EQD1	137 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	TSHB	P01222	138 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	S100P	P25815	95 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF56	Q15929	161 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFP82	Q8N141	532 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf57	Q99622	126 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	PARL	Q9H300	379 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288		H3BNG1	76 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	SIVA1	O15304	175 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	NXPH4	O95158	308 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV2-8	P01709	118 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3-30	P01768	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATXN3-238	ENST00000556288	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9

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