RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 NIT2Q9NQR4 276 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 CIDEAO60543 219 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZSN1 163 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 NACAE9PAV3 2078 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 PMCHL1Q16048 86 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 DKK2Q9UBU2 259 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 P0DMU3 169 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 FAM231AP0DMU4 169 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 FAM231CP0DMU5 169 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRR-209ENST00000549308 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 TCAPO15273 167 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 DAD1P61803 113 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 MRAPQ8TCY5 172 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 LINC01546A6NGU7 62 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 K7EQD1 137 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 VCYO14598 125 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 LAGE3Q14657 143 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 C18orf15Q96N68 181 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 SPATA25Q9BR10 227 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 CELA1Q9UNI1 258 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 FHL2Q14192 279 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 KIR2DL4Q99706 377 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 K7EMI3 77 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 LEPROTL1O95214 131 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 HBDP02042 147 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 FCER1GP30273 86 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 Q9UF83 564 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 I3L3M4 83 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 NUDT3O95989 172 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 RHOHQ15669 191 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 A0A096LNJ9 63 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE12JA6NER3 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 ATP5G1P05496 136 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 KRTDAPP60985 99 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE1Q13065 139 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE4Q13068 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE5Q13069 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE13Q4V321 117 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 A0A0J9YWU9 116 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRR-209ENST00000549308 ZMAT4Q9H898 229 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRR-209ENST00000549308 HTN3P15516 51 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 F5H768 121 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 CRYBA4P53673 196 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 C12orf74Q32Q52 190 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRR-209ENST00000549308 C3orf79P0CE67 100 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRR-209ENST00000549308 UBE2D3P61077 147 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRR-209ENST00000549308 COTL1Q14019 142 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 TOMM6Q96B49 74 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 A0A0J9YY99 117 aa8.49□□□□□ -1.05
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