RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 K7EQD1 137 aa9.7□□□□□ -0.86
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PTPRB-205ENST00000547715 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.7□□□□□ -0.86
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PTPRB-205ENST00000547715 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.6□□□□□ -0.87
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PTPRB-205ENST00000547715 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRB-205ENST00000547715 HSBP1O75506 76 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3-30P01768 117 aa9.59□□□□□ -0.87
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