RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545436.5

LMO3-232, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 530 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-232ENST00000545436 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 TNFRSF6BO95407 300 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 TCTAP57738 103 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 NRACQ8N912 160 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 ST20Q9HBF5 79 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 F5H768 121 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 PMCHP20382 165 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 G0S2P27469 103 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 SRIP30626 198 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 Q0VG73 95 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 Q6ZTC4 211 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 LINC01549A6NIU2 74 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 VCYO14598 125 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 PAX4O43316 350 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 HOXA5P20719 270 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 NCR2O95944 276 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 LINC00694P0DN24 101 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 KIR2DL4Q99706 377 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-232ENST00000545436 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 NUPR2A6NF83 97 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BKO60814 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 NPYP01303 97 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BJP06899 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BOP23527 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BBP33778 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 TIRAPP58753 221 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BDP58876 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 UBE2D3P61077 147 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BCP62807 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 UBE2D2P62837 147 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 LCE2CQ5TA81 110 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 LINC01546A6NGU7 62 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 I3L3M4 83 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 GYPEP15421 78 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 Q6ZSN1 163 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 Q8N8P6 123 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 SMKR1H3BMG3 65 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 HTN3P15516 51 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.69□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 PKIAP61925 76 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 COTL1Q14019 142 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 FA2HQ7L5A8 372 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 BAGE3Q86Y29 109 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.68□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 LINC00614P0C842 121 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 ESDP10768 282 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 H7C423 109 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 GAS8-AS1O95177 125 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 S100A6P06703 90 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 P0DMU3 169 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 FAM231AP0DMU4 169 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 FAM231CP0DMU5 169 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 FCER1GP30273 86 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 LAGE3Q14657 143 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-232ENST00000545436 TMEM18Q96B42 140 aa8.66□□□□□ -1.02
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