RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.15□□□□□ -1.42
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.15□□□□□ -1.42
KDM5A-211ENST00000544777 A0A1B0GUV1 79 aa6.15□□□□□ -1.42
KDM5A-211ENST00000544777 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.15□□□□□ -1.42
KDM5A-211ENST00000544777 H3BMQ9 156 aa6.15□□□□□ -1.42
KDM5A-211ENST00000544777 IL15RAQ13261 267 aa6.15□□□□□ -1.42
KDM5A-211ENST00000544777 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.15□□□□□ -1.42
KDM5A-211ENST00000544777 C1orf137Q5JT78 98 aa6.15□□□□□ -1.42
KDM5A-211ENST00000544777 AQP10Q96PS8 301 aa6.15□□□□□ -1.42
KDM5A-211ENST00000544777 EPDR1Q9UM22 224 aa6.15□□□□□ -1.42
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KDM5A-211ENST00000544777 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
KDM5A-211ENST00000544777 S100A5P33763 92 aa6.13□□□□□ -1.43
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KDM5A-211ENST00000544777 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.12□□□□□ -1.43
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.12□□□□□ -1.43
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KDM5A-211ENST00000544777 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.12□□□□□ -1.43
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KDM5A-211ENST00000544777 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KDM5A-211ENST00000544777 TMBIM6P55061 237 aa6.12□□□□□ -1.43
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KDM5A-211ENST00000544777 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.12□□□□□ -1.43
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KDM5A-211ENST00000544777 A0A1W2PNN7 141 aa6.1□□□□□ -1.43
KDM5A-211ENST00000544777 A6NHS1 94 aa6.1□□□□□ -1.43
KDM5A-211ENST00000544777 UBE2L6O14933 153 aa6.1□□□□□ -1.43
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KDM5A-211ENST00000544777 STAG3L3P0CL85 134 aa6.09□□□□□ -1.43
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KDM5A-211ENST00000544777 CDIP1Q9H305 208 aa6.07□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.07□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.07□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 HSPB11Q9Y547 144 aa6.07□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.06□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 H0YIZ8 118 aa6.06□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.06□□□□□ -1.44
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KDM5A-211ENST00000544777 FGF6P10767 208 aa6.05□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 SSTP61278 116 aa6.05□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 FOXI1Q12951 378 aa6.05□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 RAB24Q969Q5 203 aa6.05□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 MLST8Q9BVC4 326 aa6.05□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 NUDT15Q9NV35 164 aa6.05□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 M0QY20 66 aa6.04□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 SIX6O95475 246 aa6.04□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 CXorf1O96002 111 aa6.04□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 DEFA3P59666 94 aa6.04□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 ISOC2Q96AB3 205 aa6.04□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.04□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 LYRM1O43325 122 aa6.03□□□□□ -1.44
KDM5A-211ENST00000544777 SNAI2O43623 268 aa6.03□□□□□ -1.44
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