RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 PRSS47A8MTI9 375 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 M0QY20 66 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 SERF1AO75920 110 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 SMIM6P0DI80 62 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 NIT1Q86X76 327 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 NRACQ8N912 160 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 C20orf78Q9BR46 151 aa7.44□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 DEFB4AO15263 64 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV3-53P01767 116 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00614P0C842 121 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 DEFB130BP0DP73 79 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 DEFB130AP0DP74 79 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 ESDP10768 282 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 FA2HQ7L5A8 372 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF479Q96JC4 524 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 C18orf15Q96N68 181 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 RETNQ9HD89 108 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 DKK2Q9UBU2 259 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 ANK2Q01484 3957 aa7.43□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 NUPR1O60356 82 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 PMCHP20382 165 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 S100A2P29034 98 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00310P59036 64 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 SPATA25Q9BR10 227 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 ST20Q9HBF5 79 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 NIT2Q9NQR4 276 aa7.42□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 HSBP1O75506 76 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 AKR1D1P51857 326 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 DAD1P61803 113 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 Q6ZSN1 163 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 Q8N8P6 123 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 MRAPQ8TCY5 172 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.41□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 VCYO14598 125 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM18Q96B42 140 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.4□□□□□ -1.22
TRPS1-210ENST00000519815 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 LINC01546A6NGU7 62 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 FHL2Q14192 279 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 CELA1Q9UNI1 258 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.39□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 IFITM10A6NMD0 228 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 LINC00587B1AMM8 73 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 K7EMI3 77 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 K7EQD1 137 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 P0DMU3 169 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 FAM231AP0DMU4 169 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 FAM231CP0DMU5 169 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 FABP4P15090 132 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 AMTP48728 403 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.38□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 ATP5G1P05496 136 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 LAGE3Q14657 143 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 KIR2DL4Q99706 377 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 B9D2Q9BPU9 175 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.37□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 NOTCH1P46531 2555 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0J9YWU9 116 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 I3L3M4 83 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 TCAPO15273 167 aa7.36□□□□□ -1.23
TRPS1-210ENST00000519815 RHOHQ15669 191 aa7.36□□□□□ -1.23
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