RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511105.1

PTPN13-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

TSL 3

Gene PTPN13, Length 645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-208	ENST00000511105		C9JCJ5	164 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CXCL2	P19875	107 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ATP6V0C	P27449	155 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CSN1S1	P47710	185 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TCTA	P57738	103 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	GUK1	Q16774	197 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PRNT	Q86SH4	94 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CEND1	Q8N111	149 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SUN5	Q8TC36	379 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105		A0A1B0GVY2	172 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	KLLN	B2CW77	178 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105		H7C1H1	209 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ARPC5	O15511	151 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SPINK4	O60575	86 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CRISP2	P16562	243 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	M6PR	P20645	277 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CCL18	P55774	89 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TAL2	Q16559	108 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PRELID1	Q9Y255	219 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105		A0A1B0GW15	77 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105		K7EN84	100 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TYMS	P04818	313 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	GCHFR	P30047	84 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TAS2R45	P59539	299 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF266	Q14584	549 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	RNF212	Q495C1	297 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	KHDC3L	Q587J8	217 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105		Q6ZR54	194 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	OTOR	Q9NRC9	128 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PSG8	Q9UQ74	426 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105		G3V3Q6	166 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105		M0R036	132 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PTTG1	O95997	202 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	IFNA7	P01567	189 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	C1QB	P02746	253 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TCRA	P04437	139 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PET100	P0DJ07	73 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CRYBA4	P53673	196 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TCL1A	P56279	114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PDE6H	Q13956	83 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	RGS21	Q2M5E4	152 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	AQP10	Q96PS8	301 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	EPDR1	Q9UM22	224 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	PKD1	P98161	4303 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	GGTLC3	B5MD39	225 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	CXorf1	O96002	111 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	IGHV3-30	P01768	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPN13-208	ENST00000511105	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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