RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 P01737 135 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 RAB5CP51148 216 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 LINC01559Q495D7 138 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 PRR27Q6MZM9 219 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 WDR73Q6P4I2 378 aa10.01□□□□□ -0.81
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SH3BP2-215ENST00000510074 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10□□□□□ -0.81
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SH3BP2-215ENST00000510074 SSTP61278 116 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
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SH3BP2-215ENST00000510074 FAM74A7A6NL05 159 aa9.95□□□□□ -0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.94□□□□□ -0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 A0A1B0GUV1 79 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 SULT1A2P50226 295 aa9.93□□□□□ -0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF726P1Q15940 193 aa9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 AKR1C3P42330 323 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-215ENST00000510074 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-215ENST00000510074 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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SH3BP2-215ENST00000510074 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 SNAI2O43623 268 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 CXCL1P09341 107 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 AP1S3Q96PC3 154 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 M0QY20 66 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 MGPP08493 103 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 IFITM3Q01628 133 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 C15orf56Q8N910 161 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.88□□□□□ -0.83
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SH3BP2-215ENST00000510074 FHITP49789 147 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
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SH3BP2-215ENST00000510074 Q6ZRP5 223 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.86□□□□□ -0.83
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SH3BP2-215ENST00000510074 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 A0A096LNI7 61 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 BAGE2Q86Y30 109 aa9.85□□□□□ -0.83
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SH3BP2-215ENST00000510074 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM231BA6NCW3 169 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP2-215ENST00000510074 PAGE4O60829 102 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 AMTP48728 403 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 RASL11AQ6T310 242 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 COTL1Q14019 142 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BP2-215ENST00000510074 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
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