RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 VAMP8Q9BV40 100 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 ZMAT4Q9H898 229 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 M0R2P5 195 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 SMIM17P0DL12 118 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF56Q15929 161 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 STPG4Q8N801 248 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM110AQ9BQ89 295 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 COL7A1Q02388 2944 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 RS1O15537 224 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 FGF6P10767 208 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 PET117Q6UWS5 81 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TOMM6Q96B49 74 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 C20orf78Q9BR46 151 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 X6R8D5 127 aa3.45□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF415Q09FC8 603 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 SMIM15Q7Z3B0 74 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 F5H697 171 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 PTH2Q96A98 100 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 IGIPA6NJ69 53 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TSTD3H0UI37 97 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 IGHV3-53P01767 116 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 BAALCQ8WXS3 180 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 NUDT3O95989 172 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 SYT8Q8NBV8 401 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 ST20Q9HBF5 79 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 WIPF1O43516 503 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 RIPPLY3P57055 190 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 PCP2Q8IVA1 136 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 DEFB4AO15263 64 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 EMP1P54849 157 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.42□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A087WX48 190 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE12BA1L429 117 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 A8MWV9 139 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE7O76087 117 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE12FP0CL80 117 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE12GP0CL81 117 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE12IP0CL82 117 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 Q6ZVH6 145 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 SPXQ9BT56 116 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 CELA1Q9UNI1 258 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00694P0DN24 101 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 DEFA6Q01524 100 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 DEFB135Q30KP9 77 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 RETNQ9HD89 108 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD28-212ENST00000497037 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms