RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490104.5

TSN-208, Transcript of translin, humanhuman

TSL 2

Gene TSN, Length 2,717 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSN-208ENST00000490104 M0QY20 66 aa9.91□□□□□ -0.82
TSN-208ENST00000490104 Q0VG73 95 aa9.91□□□□□ -0.82
TSN-208ENST00000490104 H0Y8G0 127 aa9.9□□□□□ -0.82
TSN-208ENST00000490104 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.9□□□□□ -0.82
TSN-208ENST00000490104 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.9□□□□□ -0.82
TSN-208ENST00000490104 LINC00614P0C842 121 aa9.9□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 FA2HQ7L5A8 372 aa9.9□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 A0A096LPF7 62 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 A0A0J9YWU9 116 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 LINC00173Q6ZV60 143 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 DKK2Q9UBU2 259 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 A0A0J9YY99 117 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 UBE2CO00762 179 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 RS1O15537 224 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.89□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 LYSTQ99698 3801 aa9.88□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 TENM2Q9NT68 2774 aa9.88□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.88□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 MRAP2Q96G30 205 aa9.88□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.88□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 PPBPP02775 128 aa9.88□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 GAGE12JA6NER3 117 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 DAD1P61803 113 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 DEFA6Q01524 100 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 GAGE1Q13065 139 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 GAGE4Q13068 117 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 GAGE5Q13069 117 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 GAGE13Q4V321 117 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 C18orf15Q96N68 181 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 FBN3Q75N90 2809 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 MIFP14174 115 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.87□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 A8MZ25 164 aa9.86□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 ST20Q9HBF5 79 aa9.86□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.86□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.86□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.86□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.86□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.86□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.85□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 NIT2Q9NQR4 276 aa9.85□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 F5H768 121 aa9.84□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.84□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 A0A096LNJ9 63 aa9.84□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 CTAG1AP78358 180 aa9.84□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 FHL2Q14192 279 aa9.84□□□□□ -0.83
TSN-208ENST00000490104 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.84□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 KRTDAPP60985 99 aa9.84□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.84□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 Q6ZTC4 211 aa9.84□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 RHODO00212 210 aa9.83□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.83□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 TMEM18Q96B42 140 aa9.83□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.83□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 K7EQD1 137 aa9.83□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.83□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.83□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 NUDT3O95989 172 aa9.82□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 Q8N8P6 123 aa9.82□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 C12orf74Q32Q52 190 aa9.82□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.81□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 LYRM9A8MSI8 78 aa9.81□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 H7C1H1 209 aa9.81□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 FCER1GP30273 86 aa9.81□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 SPATA25Q9BR10 227 aa9.81□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.81□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 GYPEP15421 78 aa9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 PTH2Q96A98 100 aa9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 LEPROTL1O95214 131 aa9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 LAGE3Q14657 143 aa9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.79□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 KIR2DL4Q99706 377 aa9.79□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 C20orf78Q9BR46 151 aa9.79□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.79□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.79□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 ATOH7Q8N100 152 aa9.79□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.79□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.78□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 ATP5G1P05496 136 aa9.78□□□□□ -0.84
TSN-208ENST00000490104 ESDP10768 282 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms