RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	MTOR	P42345	2549 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	CBY3	A6NI87	242 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYGD	P07320	174 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	CD7	P09564	240 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5L	O75964	103 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	INS	P01308	110 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	INSL3	P51460	131 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFA6	Q01524	100 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	LAGE3	Q14657	143 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	SPX	Q9BT56	116 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	CUBN	O60494	3623 aa		4.02	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247		A8MWV9	139 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247		M0QY20	66 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R2P5	195 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TCAP	O15273	167 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLL1	P15814	213 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	G0S2	P27469	103 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	SST	P61278	116 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	VCY	O14598	125 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	RS1	O15537	224 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	SAP30	O75446	220 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	RHOH	Q15669	191 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	STH	Q8IWL8	128 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF183	Q96D59	192 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	CITED1	Q99966	193 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	JPT2	Q9H910	190 aa		4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247		H7C1H1	209 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	DLEU1	O43261	78 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	CIDEA	O60543	219 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	MGP	P08493	103 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087WX48	190 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	IGIP	A6NJ69	53 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R143	59 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	COX8A	P10176	69 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	FXYD7	P58549	80 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	MAJIN	Q3KP22	176 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf25	Q5T742	122 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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