RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF479Q96JC4 524 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-3P60369 221 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB136Q30KP8 78 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 RASL10AQ92737 203 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 RAX2Q96IS3 184 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 C20orf173Q96LM9 149 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 ODF3Q96PU9 254 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 ANK2Q01484 3957 aa7.15□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 SAP30O75446 220 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 MGPP08493 103 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 SCGB1A1P11684 91 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 SLURP1P55000 103 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 C12orf74Q32Q52 190 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 PRR9Q5T870 116 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 DCANP1Q8TF63 244 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM141Q96I45 108 aa7.14□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 IGLL5B9A064 214 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 RRN3P1Q2M238 152 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 BAALCQ8WXS3 180 aa7.13□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 K7EQG2 157 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 CCL24O00175 119 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 SYT8Q8NBV8 401 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 DUX3Q96PT4 197 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 TIMM17AQ99595 171 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 KIR2DL4Q99706 377 aa7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 KLLNB2CW77 178 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 K7ERJ3 54 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 VCYO14598 125 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 PEMTQ9UBM1 199 aa7.11□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF815PA8K554 130 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 RHOHQ15669 191 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 PMVKQ15126 192 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE13Q4V321 117 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
POLR1A-208ENST00000486964 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.09□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf86A6NJI1 115 aa7.09□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 J3KRW8 73 aa7.09□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PRX2 142 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 VCX2Q9H322 139 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 IGIPA6NJ69 53 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 A8MTW9 85 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2D1P51668 147 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB1P60022 68 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 SIGMAR1Q99720 223 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 CITED1Q99966 193 aa7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
POLR1A-208ENST00000486964 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.06□□□□□ -1.28
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