RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 LINC01619G3V211 115 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-214ENST00000473778 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.12□□□□□ -1.11
C9orf3-214ENST00000473778 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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C9orf3-214ENST00000473778 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-214ENST00000473778 K7EMT4 169 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-214ENST00000473778 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.11□□□□□ -1.11
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C9orf3-214ENST00000473778 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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C9orf3-214ENST00000473778 C9orf85Q96MD7 179 aa8.11□□□□□ -1.11
C9orf3-214ENST00000473778 VCX2Q9H322 139 aa8.11□□□□□ -1.11
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C9orf3-214ENST00000473778 PPP1R17O96001 155 aa8.09□□□□□ -1.11
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C9orf3-214ENST00000473778 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 PROK1P58294 105 aa8.05□□□□□ -1.12
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C9orf3-214ENST00000473778 TMEM141Q96I45 108 aa8.05□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 GAGE2BQ13066 116 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 GAGE2EQ4V326 116 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.04□□□□□ -1.12
C9orf3-214ENST00000473778 CR1P17927 2039 aa8.04□□□□□ -1.12
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