RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZN92	141 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	C16orf74	Q96GX8	76 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	C14orf144	Q96I85	54 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC01549	A6NIU2	74 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230		I3L3M4	83 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	DKK2	Q9UBU2	259 aa		13.22	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	ODF1	Q14990	250 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	NACA	E9PAV3	2078 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230		P0DMU3	169 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM231A	P0DMU4	169 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM231C	P0DMU5	169 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.2	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3-53	P01767	116 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	RHOH	Q15669	191 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZTI0	123 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	ERAS	Q7Z444	233 aa		13.19	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZSN1	163 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A087WX48	190 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	DPM2	O94777	84 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	IGKC	P01834	107 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.18	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.17	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	TSHB	P01222	138 aa		13.16	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		13.16	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	ZMAT4	Q9H898	229 aa		13.16	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF479	Q96JC4	524 aa		13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	CTAG1A	P78358	180 aa		13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	STPG4	Q8N801	248 aa		13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	BAALC	Q8WXS3	180 aa		13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM141	Q96I45	108 aa		13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		13.15	□□□□□ -0.3
GCFC2-208	ENST00000472230	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE12B	A1L429	117 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230		M0R143	59 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE7	O76087	117 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE12F	P0CL80	117 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE12G	P0CL81	117 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE12I	P0CL82	117 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	APOC4	P55056	127 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	JMJD1C	Q15652	2540 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	WIPF1	O43516	503 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	TIMM17A	Q99595	171 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230		F8VRH5	84 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	PLN	P26678	52 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	IGIP	A6NJ69	53 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	EMP1	P54849	157 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230		K7EQD1	137 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	COX8A	P10176	69 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	TCTA	P57738	103 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230		Q9UF83	564 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	CIDEA	O60543	219 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	EREG	O14944	169 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	ATR	Q13535	2644 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.1	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	NMU	P48645	174 aa		13.09	□□□□□ -0.31
GCFC2-208	ENST00000472230	COTL1	Q14019	142 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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