RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470980.1

GREB1-208, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene GREB1, Length 833 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-208ENST00000470980 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.71□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 NRACQ8N912 160 aa6.71□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.71□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.71□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 MUC4Q99102 2169 aa6.7□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.7□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 PPP1R17O96001 155 aa6.7□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.7□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 PMCHL1Q16048 86 aa6.7□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 RASL10AQ92737 203 aa6.7□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 RYR3Q15413 4870 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 A0A1B0GV90 55 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 DEFB135Q30KP9 77 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 IL17DQ8TAD2 202 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 C20orf78Q9BR46 151 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.69□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 H7C1H1 209 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 RHODO00212 210 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 RS1O15537 224 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 EMP1P54849 157 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 PKIAP61925 76 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 Q6ZTI0 123 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 Q8N8P6 123 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 B9D2Q9BPU9 175 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 ST20Q9HBF5 79 aa6.68□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 GAGE12BA1L429 117 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 TMEM238C9JI98 176 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 M0QY20 66 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 GAGE7O76087 117 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 GAGE12FP0CL80 117 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 GAGE12GP0CL81 117 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 GAGE12IP0CL82 117 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 KRTDAPP60985 99 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 Q6ZWC4 215 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 OR11H2Q8NH07 326 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 X6R8D5 127 aa6.67□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.66□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 A0A1B0GV72 72 aa6.66□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 LEPROTL1O95214 131 aa6.66□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 SCGB1A1P11684 91 aa6.66□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.66□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.66□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.66□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.66□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 LINC01546A6NGU7 62 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 VCYO14598 125 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 DLEU1O43261 78 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 SCGB1D1O95968 90 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 IGHV3-53P01767 116 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 HBDP02042 147 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 LAGE3Q14657 143 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 PYY3Q5JQD4 70 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 Q6ZSN1 163 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 C14orf144Q96I85 54 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.65□□□□□ -1.34
GREB1-208ENST00000470980 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.65□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 A8MZ25 164 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 NUDT3O95989 172 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 C3orf79P0CE67 100 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 P0DMU3 169 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 FAM231AP0DMU4 169 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 FAM231CP0DMU5 169 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 FCER1GP30273 86 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 RNF183Q96D59 192 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 ZNF479Q96JC4 524 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.64□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 A0A096LNJ9 63 aa6.63□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.63□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 K7EMI3 77 aa6.63□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 DEFB4AO15263 64 aa6.63□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 DEFB130BP0DP73 79 aa6.63□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 DEFB130AP0DP74 79 aa6.63□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 MIFP14174 115 aa6.63□□□□□ -1.35
GREB1-208ENST00000470980 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms