RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 ATRQ13535 2644 aa6.84□□□□□ -1.31
SRPRB-202ENST00000466636 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 A8MZ25 164 aa6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 H3BS24 57 aa6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 C3orf79P0CE67 100 aa6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 KRTDAPP60985 99 aa6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 Q6ZSN1 163 aa6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 ST20Q9HBF5 79 aa6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 SORL1Q92673 2214 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 G3V4G9 280 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 H7C1H1 209 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 TCAPO15273 167 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 LEPROTL1O95214 131 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3-53P01767 116 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 HBDP02042 147 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 FCER1GP30273 86 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 NIT2Q9NQR4 276 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.82□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 MUC4Q99102 2169 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 K7EMI3 77 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 LAGE3Q14657 143 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB135Q30KP9 77 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.81□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 VWFP04275 2813 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE12BA1L429 117 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 VCYO14598 125 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE7O76087 117 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 SCGB1D1O95968 90 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE12FP0CL80 117 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE12GP0CL81 117 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 GAGE12IP0CL82 117 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 P0DMU3 169 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 FAM231AP0DMU4 169 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 FAM231CP0DMU5 169 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 RNF183Q96D59 192 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF479Q96JC4 524 aa6.8□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 DNHD1Q96M86 4753 aa6.79□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.79□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.79□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.79□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 OR11H2Q8NH07 326 aa6.79□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 C18orf15Q96N68 181 aa6.79□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 Q9UF83 564 aa6.79□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 CIDEAO60543 219 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 NUDT3O95989 172 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 TSHBP01222 138 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 EMP1P54849 157 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 PET117Q6UWS5 81 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 Q8NAQ8 132 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.78□□□□□ -1.32
SRPRB-202ENST00000466636 LYRM9A8MSI8 78 aa6.77□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 I3L3M4 83 aa6.77□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 MIFP14174 115 aa6.77□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 RHOHQ15669 191 aa6.77□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 TOMM6Q96B49 74 aa6.77□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 KIR2DL4Q99706 377 aa6.77□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.77□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.76□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 K7EQD1 137 aa6.76□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 FHL2Q14192 279 aa6.76□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.76□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 LINC01545Q5VT33 79 aa6.76□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.76□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.76□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.76□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.75□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 C20orf202A1L168 122 aa6.75□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 ATP5LO75964 103 aa6.75□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB130BP0DP73 79 aa6.75□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB130AP0DP74 79 aa6.75□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 S100A12P80511 92 aa6.75□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.75□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 DKK2Q9UBU2 259 aa6.75□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 LINC01549A6NIU2 74 aa6.74□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 H0Y8G0 127 aa6.74□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB4AO15263 64 aa6.74□□□□□ -1.33
SRPRB-202ENST00000466636 G0S2P27469 103 aa6.74□□□□□ -1.33
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