RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00479Q96M42 142 aa6.88□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1B0GUT8 65 aa6.88□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 PRAC2D3DTV9 90 aa6.88□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 MORN5Q5VZ52 161 aa6.88□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 Q86TA4 180 aa6.88□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.88□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.87□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 Q0VG73 95 aa6.87□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 LRBAP50851 2863 aa6.87□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.87□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 RHOHQ15669 191 aa6.87□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.87□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.87□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.87□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WWL8 130 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 PMCHL1Q16048 86 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 DCANP1Q8TF63 244 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 J3QR89 54 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 TSPAN13O95857 204 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 MUC7Q8TAX7 377 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 ZANQ9Y493 2812 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 SEC61GP60059 68 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 RMI2Q96E14 147 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 GGTLC3B5MD39 225 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 PRSS46E5RG02 174 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 GYPEP15421 78 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 GNRH2O43555 120 aa6.84□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 TSKUQ8WUA8 353 aa6.84□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 PRO0255Q9UI72 69 aa6.84□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 hDV102S1A0JD36 115 aa6.84□□□□□ -1.31
DDX39B-215ENST00000462256 K7EP34 96 aa6.84□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.84□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 Q8N1Y9 231 aa6.84□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.84□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.84□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 ETDBQ3ZM63 59 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC179H3BU77 68 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 ODF3Q96PU9 254 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 ST20Q9HBF5 79 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 C11orf52Q96A22 123 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 PTH2Q96A98 100 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 P0DMU3 169 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 FAM231AP0DMU4 169 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 FAM231CP0DMU5 169 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 OCC1Q8TAD7 63 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 C20orf173Q96LM9 149 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 HIGD1CA8MV81 97 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 KRTAP10-11P60412 298 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 Q9HAA7 133 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 HSBP1O75506 76 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 APCSP02743 223 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 HBBP68871 147 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf118A6NHY6 69 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZTI0 123 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 MT-ATP8P03928 68 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 TTC32Q5I0X7 151 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 RASL11AQ6T310 242 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 OSTCQ9NRP0 149 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 MT-ND6P03923 174 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 MALP21145 153 aa6.8□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-215ENST00000462256 IL36BQ9NZH7 164 aa6.79□□□□□ -1.32
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