RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 OR11H2Q8NH07 326 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 NIT2Q9NQR4 276 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 GAS8-AS1O95177 125 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 G0S2P27469 103 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 LINC01549A6NIU2 74 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 SMIM6P0DI80 62 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
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NISCH-203ENST00000460759 GAGE12BA1L429 117 aa9.21□□□□□ -0.94
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NISCH-203ENST00000460759 GAGE7O76087 117 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 HBDP02042 147 aa9.21□□□□□ -0.94
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NISCH-203ENST00000460759 GAGE12IP0CL82 117 aa9.21□□□□□ -0.94
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NISCH-203ENST00000460759 Q8NAQ8 132 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 KIR2DL4Q99706 377 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.2□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.2□□□□□ -0.94
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NISCH-203ENST00000460759 EMP1P54849 157 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.19□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 I3L3M4 83 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 K7EQD1 137 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 DEFA6Q01524 100 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 RHOHQ15669 191 aa9.18□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 ZNF479Q96JC4 524 aa9.18□□□□□ -0.94
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NISCH-203ENST00000460759 NOTCH1P46531 2555 aa9.17□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.17□□□□□ -0.94
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NISCH-203ENST00000460759 K7EIL1 84 aa9.15□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 ATP5LO75964 103 aa9.15□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 DEFB130BP0DP73 79 aa9.15□□□□□ -0.94
NISCH-203ENST00000460759 DEFB130AP0DP74 79 aa9.15□□□□□ -0.94
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NISCH-203ENST00000460759 KRTDAPP60985 99 aa9.15□□□□□ -0.94
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NISCH-203ENST00000460759 Q6ZSN1 163 aa9.15□□□□□ -0.94
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NISCH-203ENST00000460759 C20orf202A1L168 122 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 FHL2Q14192 279 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 PYY3Q5JQD4 70 aa9.14□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.14□□□□□ -0.95
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NISCH-203ENST00000460759 C3orf79P0CE67 100 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 PET117Q6UWS5 81 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 TOMM6Q96B49 74 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.13□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 SCGB1D1O95968 90 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 TSHBP01222 138 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 P0DMU3 169 aa9.12□□□□□ -0.95
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NISCH-203ENST00000460759 FAM231CP0DMU5 169 aa9.12□□□□□ -0.95
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NISCH-203ENST00000460759 C12orf57Q99622 126 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 PRO0255Q9UI72 69 aa9.12□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 UBE2D3P61077 147 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 UBE2D2P62837 147 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.11□□□□□ -0.95
NISCH-203ENST00000460759 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.11□□□□□ -0.95
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