RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF56Q15929 161 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIGD1BQ9P298 99 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 CBY3A6NI87 242 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 C3orf84H3BNL1 204 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 VCYO14598 125 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERASQ7Z444 233 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF575Q86XF7 245 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 RASL10AQ92737 203 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM141Q96I45 108 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 C9orf85Q96MD7 179 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 B9D2Q9BPU9 175 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZMAT4Q9H898 229 aa4.67□□□□□ -1.66
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SHQ1P1-201ENST00000437111 MUC4Q99102 2169 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR11H12B2RN74 326 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 RHODO00212 210 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNRH2O43555 120 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 INSP01308 110 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTTG1IPP53801 180 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 FXYD7P58549 80 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 RHOHQ15669 191 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 VAMP3Q15836 100 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q8N3U1 123 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR11H1Q8NG94 326 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR11H2Q8NH07 326 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSTL1Q9H114 145 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 DKK2Q9UBU2 259 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 A8MWV9 139 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 FGF6P10767 208 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB1P60022 68 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAL2Q16559 108 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.66□□□□□ -1.66
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SHQ1P1-201ENST00000437111 TIMM17AQ99595 171 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCE6AA0A183 80 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 A8MTW9 85 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAS8-AS1O95177 125 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV3-20P01619 116 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLURP1P55000 103 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB131AP59861 70 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2V1Q13404 147 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF876PQ49A33 203 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CASC10Q5T4H9 136 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q8N1Y9 231 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTH2Q96A98 100 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 DUX3Q96PT4 197 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPXQ9BT56 116 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYSTQ99698 3801 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 HERC2O95714 4834 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 H3BRM9 83 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0R2P5 195 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPSP0C0P6 89 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 EDN2P20800 178 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP10-11P60412 298 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 PMVKQ15126 192 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF124Q15973 351 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB136Q30KP8 78 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZQT7 251 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 BAALCQ8WXS3 180 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
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