RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 PMCHP20382 165 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 Q0VG73 95 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 FHL2Q14192 279 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 IQCJQ1A5X6 159 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 C12orf74Q32Q52 190 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 FA2HQ7L5A8 372 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 C20orf78Q9BR46 151 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 PRO0255Q9UI72 69 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 NACAE9PAV3 2078 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 NRACQ8N912 160 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 PAX4O43316 350 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 GAS8-AS1O95177 125 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZSN1 163 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE12JA6NER3 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 P0DMU3 169 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 FAM231AP0DMU4 169 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 FAM231CP0DMU5 169 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 CRYBA4P53673 196 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE1Q13065 139 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE4Q13068 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE5Q13069 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE13Q4V321 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZTC4 211 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 KIR2DL4Q99706 377 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS47A8MTI9 375 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 VCYO14598 125 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 TCAPO15273 167 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HSBP1O75506 76 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00614P0C842 121 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 GYPEP15421 78 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HOXA5P20719 270 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 FCER1GP30273 86 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 NIT1Q86X76 327 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 Q8N8P6 123 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0J9YY99 117 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 I3L3M4 83 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 K7EMI3 77 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 SERF1AO75920 110 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 S100A2P29034 98 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 G0S2P27469 103 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 COTL1Q14019 142 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2D3P61077 147 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2D2P62837 147 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 LAGE3Q14657 143 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 H3BNG1 76 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 NUDT3O95989 172 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 AMTP48728 403 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM18Q96B42 140 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 Q9UF83 564 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-201ENST00000368202 A0A096LPF7 62 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 C5orf52A6NGY3 159 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 HBDP02042 147 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRK-201ENST00000368202 ESDP10768 282 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms