RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364096.1

RN7SKP87-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 87, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP87, Length 301 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP87-201ENST00000364096 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.65□□□□□ -1.34
RN7SKP87-201ENST00000364096 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 TNFRSF6BO95407 300 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 SRIP30626 198 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 NRACQ8N912 160 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 C20orf78Q9BR46 151 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 ST20Q9HBF5 79 aa6.64□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 H3BNG1 76 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 GAS8-AS1O95177 125 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 NPYP01303 97 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 P0DMU3 169 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 FAM231AP0DMU4 169 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 FAM231CP0DMU5 169 aa6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 A0A0J9YY99 117 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 GYPEP15421 78 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 RAB5BP61020 215 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.62□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 GAGE12JA6NER3 117 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 PRSS47A8MTI9 375 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 VCYO14598 125 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 PMCHP20382 165 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 GAGE1Q13065 139 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 GAGE4Q13068 117 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 GAGE5Q13069 117 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 GAGE13Q4V321 117 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 Q9UF83 564 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.61□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST1H2BKO60814 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST1H2BJP06899 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST1H2BOP23527 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST1H2BBP33778 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST1H2BDP58876 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 UBE2D3P61077 147 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST1H2BCP62807 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 UBE2D2P62837 147 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 Q0VG73 95 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 BAGE3Q86Y29 109 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 COL7A1Q02388 2944 aa6.6□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 NACAE9PAV3 2078 aa6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 NUPR2A6NF83 97 aa6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 I3L3M4 83 aa6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 TCAPO15273 167 aa6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 LINC00694P0DN24 101 aa6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 Q8N8P6 123 aa6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 KIR2DL4Q99706 377 aa6.59□□□□□ -1.35
RN7SKP87-201ENST00000364096 IGLL5B9A064 214 aa6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 K7EMI3 77 aa6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 NUDT3O95989 172 aa6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 FCER1GP30273 86 aa6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 IQCJQ1A5X6 159 aa6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 FA2HQ7L5A8 372 aa6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.57□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 A0A096LPF7 62 aa6.57□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 LINC00614P0C842 121 aa6.57□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 COTL1Q14019 142 aa6.57□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 NIT1Q86X76 327 aa6.57□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.57□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.57□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.57□□□□□ -1.36
RN7SKP87-201ENST00000364096 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms