RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340305.9

TMEM201-201, Transcript of transmembrane protein 201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM201, Length 3,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201-201ENST00000340305 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 SIRPDQ9H106 197 aa10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 IGHV3-33P01772 117 aa10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 BLCAPP62952 87 aa10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 GAGE5Q13069 117 aa10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 GAGE6Q13070 117 aa10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 A0A1W2PPR1 153 aa10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 C2orf82Q6UX34 121 aa10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 DUX3Q96PT4 197 aa10.35□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 TMEM262E9PQX1 116 aa10.34□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 UBE2E1P51965 193 aa10.34□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 EBI3Q14213 229 aa10.34□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.34□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 LINC01619G3V211 115 aa10.34□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 LINC01620Q4KN68 170 aa10.34□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 SMIM20Q8N5G0 67 aa10.34□□□□□ -0.75
TMEM201-201ENST00000340305 OOSP1A8MZH6 123 aa10.33□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 CD28P10747 220 aa10.33□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 PPP1R17O96001 155 aa10.33□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 PROK1P58294 105 aa10.33□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 SONP18583 2426 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.32□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 FAM208BQ5VWN6 2430 aa10.32□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa10.32□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 H3BUX3 64 aa10.32□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 TRIAP1O43715 76 aa10.32□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 LINC00315P59091 139 aa10.32□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 ATXN8Q156A1 80 aa10.32□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 U3KQE9 123 aa10.32□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 TMEM141Q96I45 108 aa10.31□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 MOB4Q9Y3A3 225 aa10.31□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 CACNA1AO00555 2505 aa10.3□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 H3BMM0 161 aa10.3□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 UBE2WQ96B02 151 aa10.3□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 TIMM21Q9BVV7 248 aa10.3□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 JMJD1CQ15652 2540 aa10.3□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 IFITM1P13164 125 aa10.3□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 ADORA2A-AS1P86434 159 aa10.3□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 RHODO00212 210 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 A0A0J9YXY3 114 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 LENEPQ9Y5L5 61 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 GAGE12JA6NER3 117 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 LEPROTO15243 131 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 GAGE7O76087 117 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 GAGE12FP0CL80 117 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 GAGE12GP0CL81 117 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 GAGE12IP0CL82 117 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 GAGE4Q13068 117 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 Q9UF83 564 aa10.29□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 TMEM223A0PJW6 202 aa10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 AMELXQ99217 191 aa10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 ACACBO00763 2458 aa10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 NDUFA4O00483 81 aa10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 TIMM17AQ99595 171 aa10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.28□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 ABCA2Q9BZC7 2435 aa10.27□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.27□□□□□ -0.76
TMEM201-201ENST00000340305 ID1P41134 155 aa10.27□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.27□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.27□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 M0R2P5 195 aa10.27□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 SVIPQ8NHG7 77 aa10.27□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 SOCS3O14543 225 aa10.26□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 VPS13CQ709C8 3753 aa10.26□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 FAM223BA6NKX1 122 aa10.26□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.26□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.26□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa10.26□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 M0QY20 66 aa10.26□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 HERV-K104P63124 156 aa10.26□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 RS1O15537 224 aa10.25□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 COX6CP09669 75 aa10.25□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.25□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.25□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.25□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 CITED1Q99966 193 aa10.25□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 LMO4P61968 165 aa10.24□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.24□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 A0A087WW49 117 aa10.24□□□□□ -0.77
TMEM201-201ENST00000340305 I3L3M4 83 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.4 ms