RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290295.7

HOXB13-201, Transcript of homeobox B13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB13, Length 3,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13-201ENST00000290295 Q96MF0 132 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.92□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 RASL10AQ92737 203 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 M0QXV9 152 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 NDUFA4O00483 81 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 HIVEP2P31629 2446 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 A0A1W2PRX2 142 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 HERVK_113P61574 105 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 NACAE9PAV3 2078 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 RBAKDNA6NC62 111 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 IGHG2P01859 326 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 Q8N1Y9 231 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.9□□□□□ -0.82
HOXB13-201ENST00000290295 A0A0J9YY99 117 aa9.9□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.9□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 ASIPP42127 132 aa9.9□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF56Q15929 161 aa9.9□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.9□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 USP24Q9UPU5 2620 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 CFC1BP0CG36 223 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 CFC1P0CG37 223 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 A6NDX4 124 aa9.89□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 OVOL1O14753 267 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 ZNF843Q8N446 348 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 DUX3Q96PT4 197 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.88□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 KRTAP10-9P60411 292 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 LINC00477Q96M19 166 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 ITPR1Q14643 2758 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 IGHV3-30P01768 117 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 IGF1P05019 195 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 DEFB136Q30KP8 78 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 C11orf86A6NJI1 115 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 JMJD1CQ15652 2540 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.86□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 A4D1N5 150 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.85□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 C2orf82Q6UX34 121 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 H3BMM0 161 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 PRSS2P07478 247 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 UBE2WQ96B02 151 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 GNRH2O43555 120 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXB13-201ENST00000290295 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 CRYGDP07320 174 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 LINC01620Q4KN68 170 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 J3QLI3 93 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 ATXN8Q156A1 80 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 C20orf173Q96LM9 149 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 PMVKQ15126 192 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 A0A087WWL8 130 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 H3BUA1 57 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 EDN2P20800 178 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 Q6Q795 121 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXB13-201ENST00000290295 ODF3Q96PU9 254 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms