RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 TOMM6Q96B49 74 aa10.58□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 PTH2Q96A98 100 aa10.57□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.57□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 P0DMU3 169 aa10.57□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 FAM231AP0DMU4 169 aa10.57□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 FAM231CP0DMU5 169 aa10.57□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.57□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa10.56□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 TCTAP57738 103 aa10.56□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 G0S2P27469 103 aa10.56□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 CYSLTR1Q9Y271 337 aa10.56□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa10.56□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 TENM1Q9UKZ4 2725 aa10.56□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 RHODO00212 210 aa10.55□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 ODF1Q14990 250 aa10.55□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 STPG4Q8N801 248 aa10.55□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 CTAG1AP78358 180 aa10.55□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 RRN3P1Q2M238 152 aa10.55□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 UFSP1Q6NVU6 142 aa10.55□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 OR4C5Q8NGB2 326 aa10.55□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa10.55□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 Q6ZSN1 163 aa10.54□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 I3L3M4 83 aa10.54□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 RS1O15537 224 aa10.54□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 Q6ZTI0 123 aa10.54□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.54□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 ERASQ7Z444 233 aa10.54□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 C16orf74Q96GX8 76 aa10.54□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 IGHV3-53P01767 116 aa10.53□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 NACAE9PAV3 2078 aa10.53□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 M0R143 59 aa10.53□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 IGKCP01834 107 aa10.53□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 IL17DQ8TAD2 202 aa10.53□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
NICN1-201ENST00000273598 DPM2O94777 84 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 TP73-AS1Q9UF72 201 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 Q9UF83 564 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 VWFP04275 2813 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 A0A087WX48 190 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 EMP1P54849 157 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 BATFQ16520 125 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD39Q53RE8 183 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 ZNF479Q96JC4 524 aa10.52□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.51□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.51□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 TRGV2A0A075B6R0 118 aa10.51□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 LINC01549A6NIU2 74 aa10.51□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 EREGO14944 169 aa10.51□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 TSHBP01222 138 aa10.51□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 GAGE12BA1L429 117 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 GAGE7O76087 117 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 GAGE12FP0CL80 117 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 GAGE12GP0CL81 117 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 GAGE12IP0CL82 117 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 RHOHQ15669 191 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 BAALCQ8WXS3 180 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 C3orf56Q8N813 242 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 WFDC9Q8NEX5 89 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 ZMAT4Q9H898 229 aa10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 NMUP48645 174 aa10.49□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 RIPPLY3P57055 190 aa10.49□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.49□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 PLAC8L1A1L4L8 177 aa10.49□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 F8VRH5 84 aa10.48□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa10.48□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 TRAV4A0A0B4J268 109 aa10.48□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa10.48□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.48□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 IGIPA6NJ69 53 aa10.48□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 COX8AP10176 69 aa10.48□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.48□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 PLNP26678 52 aa10.47□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.47□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 TMEM141Q96I45 108 aa10.47□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.47□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.47□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 TIMM17AQ99595 171 aa10.46□□□□□ -0.73
NICN1-201ENST00000273598 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
NICN1-201ENST00000273598 OVOL2Q9BRP0 275 aa10.45□□□□□ -0.74
NICN1-201ENST00000273598 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
NICN1-201ENST00000273598 PMVKQ15126 192 aa10.45□□□□□ -0.74
NICN1-201ENST00000273598 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
NICN1-201ENST00000273598 K7EQD1 137 aa10.44□□□□□ -0.74
NICN1-201ENST00000273598 APOC4P55056 127 aa10.44□□□□□ -0.74
NICN1-201ENST00000273598 COTL1Q14019 142 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms