RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 BRI3O95415 125 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00482Q8N8I6 264 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 GLMPQ8WWB7 406 aa19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NJY4 79 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMD13Q5VXD3 122 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10J6PQ8NGY7 276 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENOKQ9Y6D0 94 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ASIPP42127 132 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FHL3Q13643 280 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGMAR1Q99720 223 aa19.59■□□□□ 0.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SLURP1P55000 103 aa19.58■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 OXLD1Q5BKU9 147 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 WFDC9Q8NEX5 89 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL32P62910 135 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GAGE13Q4V321 117 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RASL10AQ92737 203 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 USMG5Q96IX5 58 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa19.57■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa19.56■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 POM121L12Q8N7R1 296 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAH3Q8TD57 4116 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A4P26447 101 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 APRG1Q8IVJ8 170 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa19.55■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA4O00483 81 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR9Q5T870 116 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA25Q9BR10 227 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CIDEAO60543 219 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 WFDC2Q14508 124 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf66Q6UXQ4 117 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 BAALCQ8WXS3 180 aa19.53■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GAGE12HA6NDE8 117 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM19A4Q96LR4 140 aa19.52■□□□□ 0.72
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BMG7 143 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL3P36405 182 aa19.51■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 SOCS3O14543 225 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 NXPH4O95158 308 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf173Q96LM9 149 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PRO0461Q9UI25 63 aa19.5■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 LYRM7Q5U5X0 104 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PRADC1Q9BSG0 188 aa19.49■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS29PA6NIE9 313 aa19.48■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 AZU1P20160 251 aa19.48■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 HERVK_113P61574 105 aa19.47■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZQT7 251 aa19.47■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 CYSLTR1Q9Y271 337 aa19.47■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa19.46■□□□□ 0.71
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF815PA8K554 130 aa19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNJ2BPP57105 145 aa19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 GPHB5Q86YW7 130 aa19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2D1P51668 147 aa19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ETDBQ3ZM63 59 aa19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM141Q96I45 108 aa19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MGPP08493 103 aa19.43■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 EDN2P20800 178 aa19.43■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB1D4Q6XE38 83 aa19.43■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa19.42■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 GTSF1LQ9H1H1 148 aa19.41■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP19.41■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 BEAN1Q3B7T3 259 aa19.41■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 AMTNQ6UX39 209 aa19.4■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D6Q7Z4S9 175 aa19.4■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM17AQ99595 171 aa19.4■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP10-11P60412 298 aa19.39■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PMVKQ15126 192 aa19.39■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa19.39■□□□□ 0.7
CAPNS1-201ENST00000246533 AGRNO00468 2067 aa19.39■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 VCYO14598 125 aa19.39■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 VCX2Q9H322 139 aa19.39■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP126Q5VTH2 177 aa19.38■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa19.38■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa19.38■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 SORL1Q92673 2214 aa19.38■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 IGIPA6NJ69 53 aa19.37■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 APOMO95445 188 aa19.37■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR2DL4Q99706 377 aa19.37■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GV72 72 aa19.37■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 J3KRW8 73 aa19.37■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa19.36■□□□□ 0.69
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