RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	OR51M1	Q9H341	326 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	KLLN	B2CW77	178 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PET100	P0DJ07	73 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	CRISP2	P16562	243 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	M6PR	P20645	277 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	TSPO	P30536	169 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	RHOB	P62745	196 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	BTN1A1	Q13410	526 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	PDE6H	Q13956	83 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	GUK1	Q16774	197 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	SUN5	Q8TC36	379 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	TVP23C	Q96ET8	276 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768		Q9HAA7	133 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MLH1-223	ENST00000616768	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768		A0A096LPF7	62 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	GGTLC3	B5MD39	225 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	OR7C2	O60412	319 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	S100A7	P31151	101 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	TAS2R60	P59551	318 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	GNG5	P63218	68 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	S100A7A	Q86SG5	101 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	ODF3	Q96PU9	254 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF492	Q9P255	531 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	C7orf71	A4D174	169 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	ARPC5	O15511	151 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	STAG3L2	P0CL84	134 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	HTN1	P15515	57 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	GCHFR	P30047	84 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	FHIT	P49789	147 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	KHDC3L	Q587J8	217 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768		Q6ZTI0	123 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	ASB13	Q8WXK3	278 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	LINC01587	Q99440	93 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	PARL	Q9H300	379 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	VAX2	Q9UIW0	290 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	RNF24	Q9Y225	148 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	PRELID1	Q9Y255	219 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	RBAKDN	A6NC62	111 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	PGP	A6NDG6	321 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768		F6UZH7	168 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768		H7BYZ3	331 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	CRYGD	P07320	174 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	EVI2A	P22794	236 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	LEP	P41159	167 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF138	P52744	262 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	SERF2	P84101	59 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF266	Q14584	549 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	HYLS1	Q96M11	299 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	LINC00477	Q96M19	166 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	OTOR	Q9NRC9	128 aa		3	□□□□□ -1.93
MLH1-223	ENST00000616768	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		3	□□□□□ -1.93

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