RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.55□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 TCRAP04437 139 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC3-212ENST00000597259 GCHFRP30047 84 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC3-212ENST00000597259 CAMPP49913 170 aa3.55□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 CFAP126Q5VTH2 177 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC3-212ENST00000597259 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.54□□□□□ -1.84
HERC3-212ENST00000597259 M0R2P5 195 aa3.54□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 SCGB1D1O95968 90 aa3.54□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 CSN1S1P47710 185 aa3.54□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 GAGE6Q13070 117 aa3.54□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.54□□□□□ -1.84
HERC3-212ENST00000597259 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.54□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 JPT2Q9H910 190 aa3.54□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.54□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 DEFA3P59666 94 aa3.53□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.53□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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HERC3-212ENST00000597259 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 SMUG1Q53HV7 270 aa3.51□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 PRNTQ86SH4 94 aa3.51□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 Q86TA4 180 aa3.51□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
HERC3-212ENST00000597259 KCNS1Q96KK3 526 aa3.51□□□□□ -1.85
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