RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1R1AQ13522 171 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PRR9Q5T870 116 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZRG5 221 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 LRP2P98164 4655 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 F5H697 171 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 BAXQ07812 192 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF846Q147U1 533 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 MUC21Q5SSG8 566 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 RASL10AQ92737 203 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 MGST2Q99735 147 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV2-8P01709 118 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 RAB5BP61020 215 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ARL16Q0P5N6 197 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 LAGE3Q14657 143 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE13Q4V321 117 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 MCFD2Q8NI22 146 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 SOSTQ9BQB4 213 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 AAMDCQ9H7C9 122 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF492Q9P255 531 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PRO0628Q9UI54 55 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFB4O95168 129 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TAS2R30P59541 319 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PDE6HQ13956 83 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ZFP69Q49AA0 526 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 MIC13Q5XKP0 118 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TEX261Q6UWH6 196 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 FA2HQ7L5A8 372 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF138P52744 262 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 LELP1Q5T871 98 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 Q8TAT8 98 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 SPANXCQ9NY87 97 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 M0R2P5 195 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PRYO14603 147 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 TRIAP1O43715 76 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PYYP10082 97 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 RAB5CP51148 216 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF266Q14584 549 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 Q8N976 141 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 COX11Q9Y6N1 276 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV2-11P01706 119 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 CD164Q04900 197 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 RHOHQ15669 191 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 LINC01551Q86U37 167 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 Q8N3U1 123 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 RMI2Q96E14 147 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-210ENST00000578916 C7orf66A4D0T2 115 aa5.95□□□□□ -1.46
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