RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569950.1

VPS35-211, Transcript of VPS35, retromer complex component, humanhuman

TSL 5

Gene VPS35, Length 1,096 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS35-211ENST00000569950 CRYBA4P53673 196 aa6.47□□□□□ -1.37
VPS35-211ENST00000569950 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.47□□□□□ -1.37
VPS35-211ENST00000569950 ZFP82Q8N141 532 aa6.47□□□□□ -1.37
VPS35-211ENST00000569950 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.47□□□□□ -1.37
VPS35-211ENST00000569950 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 A0A087WWL8 130 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 A0A1B0GXF2 115 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 NUPR2A6NF83 97 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 A8MWV9 139 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 F2Z2F3 143 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 HTN3P15516 51 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 EVI2AP22794 236 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.46□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 RYR3Q15413 4870 aa6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 XKRY2A2RUG3 117 aa6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 F5H768 121 aa6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 SSTP61278 116 aa6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 CACNG7P62955 275 aa6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 TPPP3Q9BW30 176 aa6.45□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 A0A087WWC5 75 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 A0A096LPF7 62 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 A0A0J9YY99 117 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 A0A1B0GUT8 65 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 H3BNG1 76 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 GAS8-AS1O95177 125 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 MT-ND4LP03901 98 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 P0DMU3 169 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 FAM231AP0DMU4 169 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 FAM231CP0DMU5 169 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 GATD1Q8NB37 220 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 SYT8Q8NBV8 401 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 FAM210BQ96KR6 192 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 PRO0255Q9UI72 69 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.44□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.43□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 IGLL5B9A064 214 aa6.43□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 PPP1R2P9O14990 202 aa6.43□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 APOC3P02656 99 aa6.43□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.43□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 RNF185Q96GF1 192 aa6.43□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 YPEL4Q96NS1 127 aa6.43□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 AP1S3Q96PC3 154 aa6.43□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 K7EQD1 137 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 M0QY20 66 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 RHODO00212 210 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 CIDEAO60543 219 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 TWIST1Q15672 202 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 NDUFA5Q16718 116 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.42□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 DNAH2Q9P225 4427 aa6.41□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 PAX4O43316 350 aa6.41□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 RAB4BP61018 213 aa6.41□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 RHEBQ15382 184 aa6.41□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 IMMP2LQ96T52 175 aa6.41□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.41□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.41□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 TRGC1P0CF51 173 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 GYPEP15421 78 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 RAB4AP20338 218 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 TCTAP57738 103 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 SLAQ13239 276 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 ESRGQ1W209 222 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 SVBPQ8N300 66 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.4□□□□□ -1.38
VPS35-211ENST00000569950 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.4□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 SNAPINO95295 136 aa6.39□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 RHOHQ15669 191 aa6.39□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.39□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 AMN1Q8IY45 258 aa6.39□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.39□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.39□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.39□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.39□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.38□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 NUDT3O95989 172 aa6.38□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 MGPP08493 103 aa6.38□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 CAMPP49913 170 aa6.38□□□□□ -1.39
VPS35-211ENST00000569950 UBE2D3P61077 147 aa6.38□□□□□ -1.39
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