RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A087WW49 117 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPP1R17O96001 155 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX6B1P14854 86 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EMP1P54849 157 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00315P59091 139 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP24Q9UPU5 2620 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PPM0 123 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR11H12B2RN74 326 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CEND1Q8N111 149 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR11H1Q8NG94 326 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR11H2Q8NH07 326 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIST1H4GQ99525 98 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A0J9YX75 114 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HTN1P15515 57 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 K7EP34 96 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NXPH4O95158 308 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8N1Y9 231 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FABP2P12104 132 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF56Q15929 161 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB136Q30KP8 78 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A096LNT2 108 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 K7EQG2 157 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF580Q9UK33 172 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIR2DL4Q99706 377 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 J3QLI3 93 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTAP10-9P60411 292 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.21□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SAP30O75446 220 aa9.21□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.21□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TM2D2Q9BX73 214 aa9.21□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF702PQ9H963 129 aa9.21□□□□□ -0.93
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VCYO14598 125 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DUX3Q96PT4 197 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLURP1P55000 103 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SYT8Q8NBV8 401 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM89A2RUT3 159 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KNCNA6PVL3 124 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TSHBP01222 138 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ELANEP08246 267 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCGB1A1P11684 91 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6YL49 198 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF815PA8K554 130 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF876PQ49A33 203 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C9orf85Q96MD7 179 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CUBNO60494 3623 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C11orf86A6NJI1 115 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 G3V4G9 280 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRYGDP07320 174 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CRYBA4P53673 196 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ODF3Q96PU9 254 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 E9PLD3 99 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRM2P04554 102 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C12orf74Q32Q52 190 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGIPA6NJ69 53 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LGALS9O00182 355 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB131AP59861 70 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.18□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0QY20 66 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PMVKQ15126 192 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms