RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE7	O76087	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	HBD	P02042	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE4	Q13068	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	MLANA	Q16655	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CD69	Q07108	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PTH2	Q96A98	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	RYR3	Q15413	4870 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PGP	A6NDG6	321 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984		D6R8Y8	96 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	RHOD	O00212	210 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PRR25	Q96S07	402 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	SORL1	Q92673	2214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	RIG	Q13278	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	TAL2	Q16559	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	OVOL1	O14753	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	CRYGB	P07316	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	LINC01619	G3V211	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	EVI2A	P22794	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	PLGLA	Q15195	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	VCX2	Q9H322	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984		U3KQK5	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984		A0A087WW49	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984		H3BUA1	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	IGKC	P01834	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	TCRA	P04437	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	SLURP1	P55000	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984		Q86TA4	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984		M0QXV9	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	FCER1G	P30273	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	LYST	Q99698	3801 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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