RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 CIDEAO60543 219 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 DEFB130BP0DP73 79 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 DEFB130AP0DP74 79 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 EVI2AP22794 236 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 DAD1P61803 113 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 JPT2Q9H910 190 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 CELA1Q9UNI1 258 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-218ENST00000538020 A0A087WWL8 130 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 MGPP08493 103 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 RAB5AP20339 215 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 APCSP02743 223 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 CRYGDP07320 174 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 ZNF56Q15929 161 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 AMN1Q8IY45 258 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 FRZBQ92765 325 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 F5H697 171 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 ATP5G1P05496 136 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 MRAP2Q96G30 205 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 ZNF479Q96JC4 524 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 U3KQK5 164 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 H7C1H1 209 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-53P01767 116 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 PPBPP02775 128 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 RAB4AP20338 218 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 LINC00315P59091 139 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 SLAQ13239 276 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 C12orf74Q32Q52 190 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 RNF185Q96GF1 192 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 NACAE9PAV3 2078 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 PPP1R17O96001 155 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 CKS2P33552 79 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 ORMDL3Q8N138 153 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LMO3-218ENST00000538020 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 D6R8Y8 96 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 K7EQD1 137 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 TRGC2P03986 189 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 FHL2Q14192 279 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZTC4 211 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 PRO0255Q9UI72 69 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 F5H768 121 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 HTN3P15516 51 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 RHOHQ15669 191 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 PRELID3AQ96N28 172 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 M0QY20 66 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 PHOX2AO14813 284 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 NCR2O95944 276 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 HOXA5P20719 270 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 NIT2Q9NQR4 276 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 TENM3Q9P273 2699 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 SMKR1H3BMG3 65 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 PAX4O43316 350 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 SRIP30626 198 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 CRYBA4P53673 196 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZSN1 163 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 TNFRSF6BO95407 300 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 NPYP01303 97 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LMO3-218ENST00000538020 NRACQ8N912 160 aa8.42□□□□□ -1.06
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