RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 HYPMO75409 117 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 GCHFRP30047 84 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 HERVK_113P61574 105 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 RBX1P62877 108 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 CASC10Q5T4H9 136 aa2.93□□□□□ -1.94
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PTPRC-214ENST00000530727 C10orf113Q5VZT2 155 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.93□□□□□ -1.94
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PTPRC-214ENST00000530727 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.93□□□□□ -1.94
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PTPRC-214ENST00000530727 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
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PTPRC-214ENST00000530727 DAD1P61803 113 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRC-214ENST00000530727 OR4X2Q8NGF9 303 aa2.91□□□□□ -1.94
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