RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.03□□□□□ -1.28
HULC-201ENST00000503668 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.03□□□□□ -1.28
HULC-201ENST00000503668 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 A0A0B4J2C4 111 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 A8MWV9 139 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 P0DMU3 169 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 FAM231AP0DMU4 169 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 FAM231CP0DMU5 169 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 C9orf85Q96MD7 179 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 MDFICQ9P1T7 246 aa7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 A6NDX4 124 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 J3QQQ9 107 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TSPAN13O95857 204 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 IGHV3-30P01768 117 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 CRYGDP07320 174 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 PTH2Q96A98 100 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.01□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 CACNA1BQ00975 2339 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 LINC01548A6NM66 108 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 GATA3P23771 443 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 SUMO4Q6EEV6 95 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 SPANXDQ9BXN6 97 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 KLK15Q9H2R5 256 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TTC28Q96AY4 2481 aa7□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 GNRH2O43555 120 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TSHBP01222 138 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 ZNF688P0C7X2 276 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 PSMB2P49721 201 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 CKS1BP61024 79 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 AMTNQ6UX39 209 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 ZNF292O60281 2723 aa6.99□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TMEM223A0PJW6 202 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 I3L3M4 83 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 CFC1BP0CG36 223 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 CFC1P0CG37 223 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 Q8N1X5 172 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 ERG28Q9UKR5 140 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 F5H697 171 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 M0QY20 66 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 M0R2P5 195 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 PF4V1P10720 104 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 DSCR9P59020 149 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 CFHR3Q02985 330 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 CDSNQ15517 529 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 DCANP1Q8TF63 244 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 AMELXQ99217 191 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.97□□□□□ -1.29
HULC-201ENST00000503668 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 A0A0J9YXY3 114 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 TIMM17BO60830 172 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 IGHV3-33P01772 117 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 SPINK8P0C7L1 97 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 ATXN8Q156A1 80 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 Q6Q795 121 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 COPS9Q8WXC6 57 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 CDIP1Q9H305 208 aa6.96□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 RHODO00212 210 aa6.95□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 TCL1BO95988 128 aa6.95□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 COX6CP09669 75 aa6.95□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 IFITM1P13164 125 aa6.95□□□□□ -1.3
HULC-201ENST00000503668 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.2 ms