RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 NHLH2Q02577 135 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 KHDC3LQ587J8 217 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 WFDC1Q9HC57 220 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 SSSCA1O60232 199 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 NBEAP1P0C6P0 100 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 FHITP49789 147 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 OR5C1Q8NGR4 320 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 PARLQ9H300 379 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 NIT2Q9NQR4 276 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GV50 99 aa5□□□□□ -1.61
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PDE4D-210ENST00000503258 TAAR5O14804 337 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 FFAR4Q5NUL3 377 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 UQCC3Q6UW78 93 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 C9orf163Q8N9P6 203 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 NUDT10Q8NFP7 164 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 SMCO3A2RU48 225 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 E5RGE8 158 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 METTL15P1P0C7V9 234 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 RBX1P62877 108 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 RAB24Q969Q5 203 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 FAM24AA6NFZ4 105 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 TYMSP04818 313 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM6P0DI80 62 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 SULT1A2P50226 295 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 TAS2R45P59539 299 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 NPCDR1Q9BY65 106 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 CAV2P51636 162 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 ERCC8Q13216 396 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 SVBPQ8N300 66 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 IGSF23A1L1A6 192 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 SFTA3P0C7M3 94 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 AKR1C3P42330 323 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP10-8P60410 259 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 C14orf144Q96I85 54 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 PRR34Q9NV39 138 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 MIC13Q5XKP0 118 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 H3BP45 60 aa4.97□□□□□ -1.61
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PDE4D-210ENST00000503258 STAG3L2P0CL84 134 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 MIAQ16674 131 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.97□□□□□ -1.61
PDE4D-210ENST00000503258 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
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PDE4D-210ENST00000503258 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV3-53P01767 116 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 HTN1P15515 57 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.96□□□□□ -1.62
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PDE4D-210ENST00000503258 IL36BQ9NZH7 164 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 VAX2Q9UIW0 290 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 TNFRSF6BO95407 300 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 PET117Q6UWS5 81 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.96□□□□□ -1.62
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PDE4D-210ENST00000503258 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V0CP27449 155 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 WFDC2Q14508 124 aa4.95□□□□□ -1.62
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PDE4D-210ENST00000503258 PRR27Q6MZM9 219 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 NUDT11Q96G61 164 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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PDE4D-210ENST00000503258 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.94□□□□□ -1.62
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PDE4D-210ENST00000503258 CCL20P78556 96 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 BIN3Q9NQY0 253 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 NAGKQ9UJ70 344 aa4.94□□□□□ -1.62
PDE4D-210ENST00000503258 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.94□□□□□ -1.62
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