RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ADIRFQ15847 76 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 FMC1Q96HJ9 113 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 RETNQ9HD89 108 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 NAGKQ9UJ70 344 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 GRIFINA4D1Z8 144 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 A8MTW9 85 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 KLLNB2CW77 178 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 GNRH2O43555 120 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 SH2D1AO60880 128 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 ORM1P02763 201 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 GZMBP10144 247 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 LINC01551Q86U37 167 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01587Q99440 93 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 NAT8Q9UHE5 227 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf71A4D174 169 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ISOC2Q96AB3 205 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 SEC11CQ9BY50 192 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM189A5PLL7 270 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 SPINK4O60575 86 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 P01737 135 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 EMP1P54849 157 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TCL1AP56279 114 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 RNF212Q495C1 297 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 Q6AWC8 147 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 OR11H2Q8NH07 326 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 RCHY1Q96PM5 261 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ODF3Q96PU9 254 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 B4DEV8 164 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 KRBOX1C9JBD0 128 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 H3BVH4 76 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 H7BYZ3 331 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 K7EQD1 137 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 SCO1O75880 301 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TYMSP04818 313 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 MAJINQ3KP22 176 aa3.34□□□□□ -1.87
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