RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A096LNJ9	63 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230		H0Y8G0	127 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	C20orf78	Q9BR46	151 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	PET117	Q6UWS5	81 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	FCER1G	P30273	86 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00315	P59091	139 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	ATOH7	Q8N100	152 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	DDT	P30046	118 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	LAGE3	Q14657	143 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF56	Q15929	161 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230		M0R2P5	195 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	TCAP	O15273	167 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	CITED1	Q99966	193 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	PRM2	P04554	102 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	INSL3	P51460	131 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	SPATA45	Q537H7	98 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	ST20	Q9HBF5	79 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	CRYGD	P07320	174 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	SPX	Q9BT56	116 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	NUDT3	O95989	172 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	C18orf15	Q96N68	181 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	CSTL1	Q9H114	145 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230		K7EMI3	77 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GCFC2-208	ENST00000472230		A8MWV9	139 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFA6	Q01524	100 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC01545	Q5VT33	79 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	PTH2	Q96A98	100 aa		13.33	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP5L	O75964	103 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		13.31	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230		H7C1H1	209 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	AZU1	P20160	251 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	MAJIN	Q3KP22	176 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230		M0QY20	66 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	VCY	O14598	125 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	PRSS1	P07477	247 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	KIR2DL4	Q99706	377 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	RHOD	O00212	210 aa		13.27	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	G0S2	P27469	103 aa		13.27	□□□□□ -0.28
GCFC2-208	ENST00000472230	hDV102S1	A0JD36	115 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLL1	P15814	213 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	TOMM6	Q96B49	74 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	F8	P00451	2351 aa		13.26	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	RS1	O15537	224 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLC3	P0DOY3	106 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		13.25	□□□□□ -0.29
GCFC2-208	ENST00000472230	IL17D	Q8TAD2	202 aa		13.25	□□□□□ -0.29

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