RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 APLNQ9ULZ1 77 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 FAM231BA6NCW3 169 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 RHODO00212 210 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1R2P9O14990 202 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 CIDEAO60543 219 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 MT-ND4LP03901 98 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 CRYGDP07320 174 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 SMIM17P0DL12 118 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 TCTAP57738 103 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 Q6ZSN1 163 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 NUP35Q8NFH5 326 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 LYSTQ99698 3801 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.17□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 F5H697 171 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 TRGC1P0CF51 173 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 GYPEP15421 78 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF56Q15929 161 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 WDR73Q6P4I2 378 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 CNFNQ9BYD5 112 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 NACAE9PAV3 2078 aa6.16□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 A0A096LPF7 62 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GUT8 65 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 H3BNG1 76 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 K7EQD1 137 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 APOC3P02656 99 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 MGPP08493 103 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 EVI2AP22794 236 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 RHOHQ15669 191 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.15□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 LY6G6CO95867 125 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 P0DMU3 169 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 FAM231AP0DMU4 169 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 FAM231CP0DMU5 169 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 LINC00315P59091 139 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 RAB4BP61018 213 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 RIGQ13278 110 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 NDUFA5Q16718 116 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 Q9UF83 564 aa6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 GAGE12JA6NER3 117 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 SRIP30626 198 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 GAGE1Q13065 139 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 GAGE4Q13068 117 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 GAGE5Q13069 117 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 GAGE13Q4V321 117 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.13□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 CAMPP49913 170 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 RHEBQ15382 184 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 ESRGQ1W209 222 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 SVBPQ8N300 66 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.12□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 LCE6AA0A183 80 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 M0QY20 66 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 SNAPINO95295 136 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 CCL18P55774 89 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 HBBP68871 147 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 AMN1Q8IY45 258 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.11□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 A0A087WWC5 75 aa6.1□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GW15 77 aa6.1□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GXF2 115 aa6.1□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 H7C1H1 209 aa6.1□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.1□□□□□ -1.43
CASQ1-202ENST00000467691 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms