RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 KCNS1Q96KK3 526 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf3-210ENST00000462125 SGK494Q96LW2 274 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf3-210ENST00000462125 PSG8Q9UQ74 426 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf3-210ENST00000462125 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.09□□□□□ -0.95
C9orf3-210ENST00000462125 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 K7EN84 100 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 M0R2P5 195 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF479Q96JC4 524 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 C8orf49Q96NF6 230 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 NAGKQ9UJ70 344 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.08□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV2-8P01709 118 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.07□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 LTAP01374 205 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 CT83Q5H943 113 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 Q86TA4 180 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 V9GYV3 84 aa9.06□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 K7EQD1 137 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 SIVA1O15304 175 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 ORM1P02763 201 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 SMUG1Q53HV7 270 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 PRNTQ86SH4 94 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 PTH2Q96A98 100 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00479Q96M42 142 aa9.05□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 MT-ND6P03923 174 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 WDR73Q6P4I2 378 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 ZFP82Q8N141 532 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 MLST8Q9BVC4 326 aa9.04□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 CIDEAO60543 219 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 NXPH4O95158 308 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 TRGC2P03986 189 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 RASL11AQ6T310 242 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF575Q86XF7 245 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 C9orf85Q96MD7 179 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.03□□□□□ -0.96
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 FAM231BA6NCW3 169 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 A8MWL6 223 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 RS1O15537 224 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 P01737 135 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 GYPEP15421 78 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 SRIP30626 198 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF876PQ49A33 203 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.02□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 C5orf52A6NGY3 159 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 TSKUQ8WUA8 353 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 NUDT11Q96G61 164 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.01□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 C19orf71A6NCJ1 209 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 K7EP13 123 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 TRGC1P0CF51 173 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 CRIP1P50238 77 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 TIRAPP58753 221 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00315P59091 139 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 CFAP126Q5VTH2 177 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 XKRY2A2RUG3 117 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 C16orf90A8MZG2 172 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BKO60814 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 S100A8P05109 93 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BJP06899 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BOP23527 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BBP33778 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BDP58876 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BCP62807 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 PRR27Q6MZM9 219 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms