RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459988.1

UBAP2-208, Transcript of ubiquitin associated protein 2, human

TSL 2

Gene UBAP2, Length 2,628 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBAP2-208	ENST00000459988	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	SRI	P30626	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	BLCAP	P62952	87 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988		Q75L30	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988		F2Z2F3	143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988		Q8N1X5	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988		A0A0G2JLM5	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988		A0A1B0GUT8	65 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	SH2D1A	O60880	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	VGLL1	Q99990	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988		A0A1W2PS18	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	GPX1	P07203	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	PSMB8	P28062	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	PKIA	P61925	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	RIG	Q13278	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988		Q8TAT8	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988		A0A1B0GVY2	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	CTRL	P40313	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	SOCS3	O14543	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	AMT	P48728	403 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	CD164	Q04900	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	NIT1	Q86X76	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF138	P52744	262 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ERCC8	Q13216	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988		Q6ZSV7	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBAP2-208	ENST00000459988	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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