RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438354.6

LYVE1-202, Transcript of lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1, humanhuman

TSL 5

Gene LYVE1, Length 1,823 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1-202ENST00000438354 DERL1Q9BUN8 251 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 PGPA6NDG6 321 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 IGKV3-20P01619 116 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 AMBPP02760 352 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 TAS2R45P59539 299 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 DEFB131AP59861 70 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 ERCC8Q13216 396 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 DEFB125Q8N687 156 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 RXFP4Q8TDU9 374 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 FMC1Q96HJ9 113 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 VGLL1Q99990 258 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 FBN3Q75N90 2809 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 SMIM17P0DL12 118 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 ERVFC1-1P60608 527 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 Q8N1X5 172 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 Q8TAT8 98 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 KIR2DL4Q99706 377 aa5.23□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 TGP01266 2768 aa5.22□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 SNURFLB1AK76 121 aa5.22□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 PSG9Q00887 426 aa5.22□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 PYY3Q5JQD4 70 aa5.22□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.22□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 LCN12Q6JVE5 192 aa5.22□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 TVP23CQ96ET8 276 aa5.22□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 MED9Q9NWA0 146 aa5.22□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.21□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 C11orf94C9JXX5 98 aa5.21□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 IGLV2-11P01706 119 aa5.21□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 BCL2P10415 239 aa5.21□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 FXYD7P58549 80 aa5.21□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.21□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.21□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.21□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 ISLRO14498 428 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 PRM2P04554 102 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 PSMB3P49720 205 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 PRR9Q5T870 116 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 OTORQ9NRC9 128 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 VAX2Q9UIW0 290 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 GAGE12JA6NER3 117 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 GAGE7O76087 117 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 TCRAP04437 139 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 GAGE12FP0CL80 117 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 GAGE12GP0CL81 117 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 GAGE12IP0CL82 117 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 CT45A10P0DMU9 189 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 INSL3P51460 131 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 GAGE4Q13068 117 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 PDE6HQ13956 83 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 RHEBQ15382 184 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 LCE4AQ5TA78 99 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 EPDR1Q9UM22 224 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.2□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 A0A0J9YX75 114 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 C9JAW5 83 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 K7EIL1 84 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 M0R2Z0 102 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 PEX7O00628 323 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 ZNF253O75346 499 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 ADCYAP1P18509 176 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 AMTNQ6UX39 209 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.19□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 H3BMM0 161 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 MANBALQ9NQG1 85 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 IGLV2-8P01709 118 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
LYVE1-202ENST00000438354 PRNTQ86SH4 94 aa5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms