RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLLNB2CW77 178 aa4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMKR1H3BMG3 65 aa4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 COX8AP10176 69 aa4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 MUC21Q5SSG8 566 aa4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF152Q8N8N0 203 aa4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 C20orf173Q96LM9 149 aa4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.73□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 TENM2Q9NT68 2774 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 hDV102S1A0JD36 115 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 J3KRW8 73 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 NUDT3O95989 172 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 MGPP08493 103 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 HLA-DRB4P13762 266 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 EVI2AP22794 236 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLNP26678 52 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEC11AP67812 179 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 DCANP1Q8TF63 244 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A096LNJ9 63 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 A6NDN8 102 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 SIVA1O15304 175 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 DLEU1O43261 78 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 DPM2O94777 84 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 NXPH4O95158 308 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKCP01834 107 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRSS1P07477 247 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDKN1BP46527 198 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIR3DS1Q14943 382 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAJINQ3KP22 176 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR9Q5T870 116 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF702PQ9H963 129 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.72□□□□□ -1.65
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0J9YX75 114 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC01619G3V211 115 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 H7C1H1 209 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7EIL1 84 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7EQG2 157 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD7P09564 240 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF688P0C7X2 276 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYNJ2BPP57105 145 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 HSD52Q0P140 79 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZSV7 163 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q8N2B8 174 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 NRACQ8N912 160 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 C18orf15Q96N68 181 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIR2DL4Q99706 377 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 C16orf95Q9H693 158 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.71□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A087WW49 117 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 NMUP48645 174 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 COX11Q9Y6N1 276 aa4.7□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 F6UB75 175 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 F8VRH5 84 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TFPI2P48307 235 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 HERVK_113P61574 105 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 ODF1Q14990 250 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 MPV17L2Q567V2 206 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 XP32Q5T750 250 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 STPG4Q8N801 248 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOMM6Q96B49 74 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAX2Q96IS3 184 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.69□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A087WX48 190 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 F5H697 171 aa4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF415Q09FC8 603 aa4.68□□□□□ -1.66
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