RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 JPT2Q9H910 190 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CBY3A6NI87 242 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSBP1O75506 76 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00614P0C842 121 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APOC4P55056 127 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PMCHL1Q16048 86 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEFB125Q8N687 156 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NIT2Q9NQR4 276 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XCL2Q9UBD3 114 aa7.17□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.16□□□□□ -1.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNFRSF6BO95407 300 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPBPP02775 128 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MGPP08493 103 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HTN1P15515 57 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00315P59091 139 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FA2HQ7L5A8 372 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NRACQ8N912 160 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AP1S3Q96PC3 154 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC01587Q99440 93 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CSTL1Q9H114 145 aa7.15□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 G3V4G9 280 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.14□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A087WWL8 130 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AZU1P20160 251 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTDAPP60985 99 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q8N976 141 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RASL10AQ92737 203 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRAP2Q96G30 205 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NACAE9PAV3 2078 aa7.13□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A096LNJ9 63 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A8MZ25 164 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCGB1D1O95968 90 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C3orf79P0CE67 100 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP10-11P60412 298 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYT8Q8NBV8 401 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.12□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM229AH3BQW9 127 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRYGDP07320 174 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF415Q09FC8 603 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF876PQ49A33 203 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC01546A6NGU7 62 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRSS47A8MTI9 375 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL6A5A8TX70 2615 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMIM17P0DL12 118 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q8N8P6 123 aa7.11□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 M0R2P5 195 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LEPROTL1O95214 131 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STAB1Q9NY15 2570 aa7.1□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IL17DQ8TAD2 202 aa7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTH2Q96A98 100 aa7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 F5H697 171 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TCAPO15273 167 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF56Q15929 161 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RRN3P1Q2M238 152 aa7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms