RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 BAALCQ8WXS3 180 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 TECTAO75443 2155 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 PATE2Q6UY27 113 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 ATP5G1P05496 136 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 COX7A2LO14548 114 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 GNRH2O43555 120 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 GTSF1Q8WW33 167 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 J3KT08 172 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 K7ENP7 123 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 Q96MF0 132 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 U3KQE9 123 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 J3QKU1 62 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 NDUFA1O15239 70 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 UBE2AP49459 152 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 C16orf74Q96GX8 76 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 C10orf142B7Z368 130 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 TIMM17AQ99595 171 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 A4D1N5 150 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 GP9P14770 177 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 TEN1Q86WV5 123 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 SVIPQ8NHG7 77 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1-17P01599 117 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 Q9HAA7 133 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 LINC01620Q4KN68 170 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 COX7B2Q8TF08 81 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 PTH2Q96A98 100 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 G3V4G9 280 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 SPRNQ5BIV9 151 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 C5orf38Q86SI9 138 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0J9YXV3 536 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 A0A096LPF7 62 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf70A6NJV1 201 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV2-14P01704 120 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 FOXI1Q12951 378 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 IL17DQ8TAD2 202 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 PIFOQ8TCI5 191 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 H3BT86 120 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0J9YY99 117 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 CCL24O00175 119 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 PRB1P04280 392 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 CTSZQ9UBR2 303 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 DIRC1Q969H9 104 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 PCNTO95613 3336 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 GYPEP15421 78 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 RITA1Q96K30 269 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 K7EQD1 137 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 C14orf177Q52M58 125 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZQT7 251 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 Q6ZPA2 131 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 HIGD1BQ9P298 99 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 K7EIM0 57 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-202ENST00000400053 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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