RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 C12orf74Q32Q52 190 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 TAL2Q16559 108 aa13.27□□□□□ -0.28
SH3BP4-202ENST00000392011 SIVA1O15304 175 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV12-3P01733 135 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 K7EMI3 77 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 H3BMM0 161 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 IGHG2P01859 326 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 XCL1P47992 114 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2WQ96B02 151 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8N1Y9 231 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0J9YXV3 536 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf70A6NJV1 201 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC01548A6NM66 108 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC01545Q5VT33 79 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 F8W1H4 67 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 CCL25O15444 150 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 LMO4P61968 165 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 Q9H8V8 135 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00574Q9H8X3 128 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 DSCAMO60469 2012 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 C5orf38Q86SI9 138 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 F8WEM9 126 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZQT7 251 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 K7EMT4 169 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 GPHB5Q86YW7 130 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 SOCS3O14543 225 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFB125Q8N687 156 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 SCRT2Q9NQ03 307 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 INAFM2P0DMQ5 153 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-202ENST00000392011 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.21□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 C19orf84I3L1E1 186 aa13.21□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCA12Q86UK0 2595 aa13.21□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 TANC2Q9HCD6 1990 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 PIFOQ8TCI5 191 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ESM1Q9NQ30 184 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 NKAPP1Q8N9T2 125 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CFC1BP0CG36 223 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CFC1P0CG37 223 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CTRLP40313 264 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CARD19Q96LW7 228 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SPANXA1Q9NS26 97 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ALPK3Q96L96 1907 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 MRAPQ8TCY5 172 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC140Q96MF4 163 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 EDA2RQ9HAV5 297 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 A6NDX4 124 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV2-8P01709 118 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 GYPEP15421 78 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ODF3BA8MYP8 253 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 MDFICQ9P1T7 246 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF152Q8N8N0 203 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 CRLF1O75462 422 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-202ENST00000392011 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 Q9HAA7 133 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 K7EQD1 137 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 HAMPP81172 84 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf74Q96GX8 76 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 FXYD2P54710 66 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf66Q5T8R8 295 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0J9YX75 114 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 A4D1N5 150 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM126AQ9H061 195 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CHD8Q9HCK8 2581 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLL5B9A064 214 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 BAALCQ8WXS3 180 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 C10orf142B7Z368 130 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms