RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 ZNF124Q15973 351 aa8.3□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 PTH2Q96A98 100 aa8.3□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.3□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 LY6G6DO95868 133 aa8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 SMIM17P0DL12 118 aa8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 TCAPO15273 167 aa8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 ODF1Q14990 250 aa8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.29□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.28□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 A0A1B0GV90 55 aa8.28□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.28□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.28□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZN92 141 aa8.28□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.28□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.28□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.28□□□□□ -1.08
PGA3-201ENST00000325558 NF1P21359 2839 aa8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 M0QY20 66 aa8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 ATP5LO75964 103 aa8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 FGF6P10767 208 aa8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 TOMM6Q96B49 74 aa8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 DKK2Q9UBU2 259 aa8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 COX8AP10176 69 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP10-3P60369 221 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 SYT8Q8NBV8 401 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 A0A1W2PRX2 142 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 H0Y8G0 127 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 MGPP08493 103 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 C18orf15Q96N68 181 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.26□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 NACAE9PAV3 2078 aa8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 A0A087WWL8 130 aa8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 DLEU1O43261 78 aa8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 IGLV1-51P01701 117 aa8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 JMJD8Q96S16 334 aa8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 CSTL1Q9H114 145 aa8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.25□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.24□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 VCYO14598 125 aa8.24□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.24□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 ZNF876PQ49A33 203 aa8.24□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.24□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.24□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.24□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 STPG4Q8N801 248 aa8.24□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 A0A087WX48 190 aa8.23□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 CBY3A6NI87 242 aa8.23□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 NUDT3O95989 172 aa8.23□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 RIPPLY3P57055 190 aa8.23□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.23□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.23□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 PRM2P04554 102 aa8.23□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 IL17DQ8TAD2 202 aa8.23□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 MTORP42345 2549 aa8.22□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 IGIPA6NJ69 53 aa8.22□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 M0R2P5 195 aa8.22□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 TSHBP01222 138 aa8.22□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 PRSS1P07477 247 aa8.22□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.22□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.22□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.21□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 LINC01549A6NIU2 74 aa8.21□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 ERASQ7Z444 233 aa8.21□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.21□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 HIVEP2P31629 2446 aa8.21□□□□□ -1.09
PGA3-201ENST00000325558 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.21□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 OR11H12B2RN74 326 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 DPM2O94777 84 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 INSP01308 110 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 IGKCP01834 107 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 P0DMU3 169 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 FAM231AP0DMU4 169 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 FAM231CP0DMU5 169 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 FOSL1P15407 271 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 SPXQ9BT56 116 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 A8MWV9 139 aa8.2□□□□□ -1.1
PGA3-201ENST00000325558 F5H697 171 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms