RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306773.4

NPTX1-201, Transcript of neuronal pentraxin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPTX1, Length 5,122 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1-201ENST00000306773 PROP1O75360 226 aa14.64□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.64□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 A0A096LPF7 62 aa14.64□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.64□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.64□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.63□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.63□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.63□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.63□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 PRAC2D3DTV9 90 aa14.62□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 ATP5G1P05496 136 aa14.62□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 INAFM2P0DMQ5 153 aa14.62□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 A0A0J9YY99 117 aa14.62□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.61□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 K7EQD1 137 aa14.61□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 INSL3P51460 131 aa14.61□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 ALPK3Q96L96 1907 aa14.6□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.6□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 NXPH4O95158 308 aa14.6□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 IGHG4P01861 327 aa14.6□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 PTPN13Q12923 2485 aa14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 NACAE9PAV3 2078 aa14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 MED12LQ86YW9 2145 aa14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 IGF1P05019 195 aa14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 CDK2AP2O75956 126 aa14.59□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.58□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 Q8N1Y9 231 aa14.58□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.58□□□□□ -0.07
NPTX1-201ENST00000306773 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.58□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 CTRLP40313 264 aa14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 PLXNB1O43157 2135 aa14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 GYPEP15421 78 aa14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 SOCS3O14543 225 aa14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.57□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 EBI3Q14213 229 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 ZNF503Q96F45 646 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 CFC1BP0CG36 223 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 CFC1P0CG37 223 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 EP400Q96L91 3159 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 HERV-K104P63124 156 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 MRAPQ8TCY5 172 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 CARD19Q96LW7 228 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 A0A0J9YX75 114 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 CCDC140Q96MF4 163 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.56□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 Q6YL49 198 aa14.55□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.55□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 XCL1P47992 114 aa14.55□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 TRBV12-3P01733 135 aa14.55□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.54□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 IGLL5B9A064 214 aa14.54□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.54□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.53□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.53□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.52□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 PRSS47A8MTI9 375 aa14.52□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 Q6ZQT7 251 aa14.52□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 PKIGQ9Y2B9 76 aa14.52□□□□□ -0.08
NPTX1-201ENST00000306773 LY6LH3BQJ8 138 aa14.52□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 CRYGBP07316 175 aa14.52□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 UTF1Q5T230 341 aa14.52□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 C9orf153Q5TBE3 101 aa14.52□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 FXYD2P54710 66 aa14.52□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 LGALS9O00182 355 aa14.51□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 Q9H8V8 135 aa14.51□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.51□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 CCL18P55774 89 aa14.51□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 ZNF843Q8N446 348 aa14.5□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 TAX1BP3O14907 124 aa14.5□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 TMEM126AQ9H061 195 aa14.5□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 A0A0J9YXV3 536 aa14.49□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 LINC01548A6NM66 108 aa14.49□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 IGLV2-8P01709 118 aa14.49□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 NDUFA11Q86Y39 141 aa14.49□□□□□ -0.09
NPTX1-201ENST00000306773 ODF3Q96PU9 254 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms