RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.26□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.26□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.26□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 ATP6V0BQ99437 205 aa4.26□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 SIGMAR1Q99720 223 aa4.26□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.26□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 A0A087WW49 117 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 I3L3M4 83 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 SPINK8P0C7L1 97 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 A0A0J9YXV3 536 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 CCL24O00175 119 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 ELANEP08246 267 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 IGF2-ASQ6U949 168 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 NPBQ8NG41 125 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 RASL10AQ92737 203 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 RS1O15537 224 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C5orf38Q86SI9 138 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 MRAPQ8TCY5 172 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 EML5Q05BV3 1969 aa4.25□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 J3QQQ9 107 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 DAD1P61803 113 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 Q8N1Y9 231 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 MDFICQ9P1T7 246 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 RNF114Q9Y508 228 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 IGLV2-8P01709 118 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 FGF6P10767 208 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 ATXN8Q156A1 80 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 SIRPDQ9H106 197 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 RHODO00212 210 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 LINC01559Q495D7 138 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 DAND5Q8N907 189 aa4.24□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 K7EP13 123 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 SLC25A20O43772 301 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 CRYGCP07315 174 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 XCL1P47992 114 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZQT7 251 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C9orf118A6NHY6 69 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C10orf142B7Z368 130 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 GAGE2BQ13066 116 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 GAGE2EQ4V326 116 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 RBAKDNA6NC62 111 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 CCDC140Q96MF4 163 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 TMEM243Q9BU79 118 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 NUP210LQ5VU65 1888 aa4.23□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 PRM2P04554 102 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C2orf70A6NJV1 201 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 P0DMU3 169 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 FAM231AP0DMU4 169 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 FAM231CP0DMU5 169 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 FXYD2P54710 66 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 SS18Q15532 418 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZS46 218 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 J3QLI3 93 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 LEPROTO15243 131 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 IGHG2P01859 326 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C12orf74Q32Q52 190 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.22□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PPM0 123 aa4.21□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.21□□□□□ -1.73
LMO3-201ENST00000261169 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.21□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms