RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 SHROOM3Q8TF72 1996 aa3.03□□□□□ -1.92
MDM2-201ENST00000258148 ASXL3Q9C0F0 2248 aa3.03□□□□□ -1.92
MDM2-201ENST00000258148 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.03□□□□□ -1.92
MDM2-201ENST00000258148 ACACAQ13085 2346 aa3.03□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 ZNF737O75373 536 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 SSR2P43308 183 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 HCP5Q6MZN7 132 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 PATE1Q8WXA2 126 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 CALML5Q9NZT1 146 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 VPS13CQ709C8 3753 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 MAST4O15021 2626 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 EML6Q6ZMW3 1958 aa3.02□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 UQCRQO14949 82 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 OR4B1Q8NGF8 309 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 C1orf54Q8WWF1 131 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 COX14Q96I36 57 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 TP53RKQ96S44 253 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 ZFHX3Q15911 3703 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 RP1P56715 2156 aa3.01□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 DLEU1O43261 78 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 UBL3O95164 117 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 PIRTP0C851 137 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 AKR1D1P51857 326 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 NCS1P62166 190 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 C2orf88Q9BSF0 95 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 BANF2Q9H503 90 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 SDK2Q58EX2 2172 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 PTPN13Q12923 2485 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 LRRK2Q5S007 2527 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 HBDP02042 147 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 PRB1P04280 392 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 FABP4P15090 132 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 OR2T35Q8NGX2 323 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 HYLS1Q96M11 299 aa3□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa2.99□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 FBN2P35556 2912 aa2.99□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa2.99□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 C17orf112F2Z3M2 114 aa2.99□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 SPINT3P49223 89 aa2.99□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 FKBP11Q9NYL4 201 aa2.99□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 LRBAP50851 2863 aa2.99□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 CENPEQ02224 2701 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 CCDC88CQ9P219 2028 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 OR2T8A6NH00 312 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 CCL22O00626 93 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 APOC2P02655 101 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 CRPP02741 224 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 GPX1P07203 203 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 CCL4P13236 92 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 SELENOWP63302 87 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 TMEM91Q6ZNR0 172 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 CTAGE3PQ8IX95 158 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 LINC00471Q8N535 108 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 PSMF1Q92530 271 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 LINC00470Q9BZP3 86 aa2.98□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.97□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 J3QR89 54 aa2.97□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 GNG7O60262 68 aa2.97□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 TPT1P13693 172 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 Q1T7F1 81 aa2.97□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 TEN1Q86WV5 123 aa2.97□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 GKN2Q86XP6 184 aa2.97□□□□□ -1.93
MDM2-201ENST00000258148 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 SPTA1P02549 2419 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 DCHS2Q6V1P9 2916 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 A0A087WSZ3 146 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 hDV103S1A0JD37 113 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 C2orf70A6NJV1 201 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 E7EUB6 86 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms