RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623267.3

SNHG5-216, Transcript of small nucleolar RNA host gene 5, human

TSL 5

Gene SNHG5, Length 374 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG5-216	ENST00000623267	INS	P01308	110 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PF4	P02776	101 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PRSS1	P07477	247 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267		M0R2P5	195 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	RHOD	O00212	210 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	MGP	P08493	103 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PROK1	P58294	105 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PRR9	Q5T870	116 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267		Q6ZN92	141 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267		Q8N1Y9	231 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	FLNC	Q14315	2725 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267		A0A1W2PRX2	142 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	CRLF1	O75462	422 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SNHG5-216	ENST00000623267	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	SIVA1	O15304	175 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	NCR2	O95944	276 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	NPS	P0C0P6	89 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	HTN1	P15515	57 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	PLN	P26678	52 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	NRAC	Q8N912	160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267		H0Y8G0	127 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNHG5-216	ENST00000623267		I3L3M4	83 aa		4.2	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms